本题从第二空入手
第二空：本空前后为解释关系。
根据“人体是一个庞大的共生体”可知，人体健康和体内菌群是共生关系，共生指两种不同的生物生活在一起，相依生存，对彼此都有利，所以横线处要体现共生的意思。

A选项“同气连枝”比喻同胞的兄弟姐妹。人体健康和体内菌群不存在同胞关系，排除A。

B选项“表里相依”指关系密切，互相依存。人体健康和体内菌群并不是“表里”关系，且侧重强调“相互依存”，不是相互影响的“利益关系”，排除B。

C选项“如影随形”比喻两个人关系亲密，常在一起。不能体现二者之间利害关系，排除C。

D选项“休戚与共”忧喜、福祸彼此共同承担。形容关系密切，利害相同。可以体现人体健康和体内菌群之间的共生关系，恰当。

第一空代入验证。
“人体皮肤表面、口腔、呼吸道、肠道生存着大量微生物”搭配恰当。

故本题选D。
【2021-联考/山西-026】